Regnskovens sæsoner kan opdeles i våd- og tørperioder. Det bedste tidspunkt at besøge Amazonas i Peru afhænger af dine interesser og de oplevelser, du søger:
Tørperiode (maj til oktober)
Dette er den mest populære tid at besøge Amazonas. Vejret er generelt tørt, og der er færre insekter. Det er en ideel tid til vandreture, dyreobservation og flodture, da flodniveauerne er lavere.
Vådperiode (november til april)
Skønt det regner hyppigere, er dette en fremragende tid til at opleve det rige dyreliv, da mange planter blomstrer, og dyrene er mere aktive. Floderne er højere, hvilket gør det lettere at navigere i kano til afsidesliggende områder.